고려의학에서는 진단과 치료가 하나의 체계로 되어 있다. 고려의학의 사고방식은 경험을 근저에 두고 인간 파악을 근본으로 하고 있다라고 말할 수 있다.

침구사제도 대신 침구기사제도를 만들어, 진단은 의사 혹은 한의사가 내리고 시술은 침구기사에게 맡기자는 주장은 침구술에 대해 제대로 이해하고 있지 못하다는 반증과 다름없다.
침구술은 첩약술과 달라서 그 특성상 진단과 치료가 분리될 수 없다. 인체의 근육을 비집고 들어가는 것이 주사와 유사해, 언뜻 보기에는 별다른 문제가 없을 듯하지만 침은 주사기 안에 들어있는 약물을 인체에 주입하는 주사와는 완전히 상이하다.

침은 약물처럼 처방만으로 끝나지 않는다. 진단을 내리고 처방전을 내어주면 되는 것과는 달리 진단과 치료가 일련의 과정이 꽉 맞물려 있기 때문이다. 병증을 알아내고 침자리를 결정하고 침을 깊게 찌를지 얕게 찌를지 판단하고 얼마나 유침해 둘 것인지 가늠하고 그에 맞게 침을 놓고 환자의 안색과 반응을 살피는 과정 전체가 진단이자 곧 시술이다. 또한 이 과정은 누구도 대신할 수 없으며 대신해서도 안 되는 시술자 고유의 몫이다.
진단자의 “어떤 혈(穴)에 어떤 침을 얼마만한 깊이로 꽂아 몇 분 동안 유침해 두라”는 지시에 따라 시술자가 정확하게 침을 놓는다는 것은 현실적으로 절대 불가능할 뿐만 아니라 매우 위험한 발상이다.
침구기사제도는 환자의 건강을 볼모 삼고 침구술에 대한 국민의 정보 부족을 빌미 삼아 침구사를 의료인으로 인정하지 않으려는 속셈에 다름 아니다.