한의학계의 그와 같은 강력한 대응은 그 동안 한의학계가 일관되게 주장해왔던 내용에 정면으로 배치되기 때문이었다. 그 동안 한의학계는 침구사 제도를 부활시키려는 대한침구사협회 및 재야 침구인들의 노고와 주장을 부정해왔다. 침구시술을 전문적으로 시행할 수 있는 전문인은 오직 한의사뿐이라는 입장이었다. 그러나 배원식씨가 제출한 청원서는 한의사만이 침구시술을 할 수 있다는 주장에 대한 근거를 상당 부분 희석시키는 결과를 가져왔다.

배씨가 제출한 청원서에 대하여 의료보험조합연합회는 “현행 의료법상 한의사 면허를 소지하고 한의원을 개설한 자는 침구행위가 가능하며 따라서 청구인의 침구시술행위도 위법이 아니”라는 회신을 보냈다. 국민고충처리위원회는 청원이 이유 없음을 들어 각하했다. 다시 말해, “침구술을 배운 적도 없고 시술한 적도 없지만 한의사이므로 침구 시술을 해도 된다”는 면죄부를 준 것이다. 이는 ‘면허 있는 자만이 의료 행위를 할 수 있도록' 한 의료인 면허 제도의 본래 취지에 정면으로 어긋나는 일이다.